1º informe de detección molecular de circulación de aMPV en aves domésticas y silvestres en Colombia

El Metapneumovirus Aviar (MPVa) es un virus ARN que pertenece al Complejo Respiratorio Aviar (PRA). Es un virus ARN que causa enfermedades respiratorias y reproductivas. Se han reportado seis subtipos a nivel mundial: A, B, C, D, GuMPV-B29 y MK491499, que pueden afectar aves de corral, patos domésticos, faisanes, así como aves silvestres locales y migratorias.

Las aves silvestres migratorias en particular actúan como reservorios y pueden facilitar la propagación del virus en las regiones productivas. Hasta el momento no existen reportes de la prevalencia o circulación del virus en Colombia, y no se han aprobado vacunas vivas para su uso en aves de corral. Se trata de una enfermedad subdiagnosticada, debido a una combinación de sintomatología leve en las aves infectadas y el sesgo hacia otras enfermedades del PRA. Con base en esto, el propósito de este proyecto fue realizar un estudio transversal dirigido a determinar la presencia de MPVa y sus características moleculares en aves comerciales y silvestres en diferentes regiones de Colombia.

Las muestras se recolectaron por conveniencia en granjas avícolas, aves de traspatio y aves silvestres ingresadas a la Unidad de Rescate y Rehabilitación de Fauna Silvestre de la Facultad de Medicina Veterinaria y Zootecnia de la Universidad Nacional de Colombia. Se tomaron 200 hisopos del tracto respiratorio y/o reproductivo de aves de corral y 73 de aves silvestres. La detección viral se realizó mediante la amplificación de los genes de la Nucleocápside (N) y la Glicoproteína (G) mediante PCR. Las muestras positivas se secuenciaron y analizaron las relaciones filogenéticas y los eventos de recombinación. Hasta el momento, se ha detectado aMPV subtipo B en 15 muestras de granjas avícolas y una de una paloma bravía (Columba livia).

Estos resultados demuestran por primera vez evidencia molecular de la circulación de aMPV en aves domésticas y silvestres en Colombia, contribuyendo a la comprensión de la dinámica viral, la ecología y la preservación de las poblaciones de aves silvestres, así como a garantizar la seguridad alimentaria asociada a la producción avícola. También proporcionan datos epidemiológicos relevantes para orientar las estrategias de monitoreo y control de enfermedades en el país.

Palabras clave: Enfermedades avícolas; Virus; ARN; Patógenos; Biología molecular; Detección molecular; PCR; Secuenciación; Aves de corral; Aves silvestres

Avian Metapneumovirus (aMPV) is a member of the Avian Respiratory Complex (ARP). This is a RNA virus that causes both respiratory and reproductive diseases. Six subtypes have been reported worldwide: A, B, C, D, GuMPV-B29, and MK491499, which can affect poultry, domestic ducks, pheasants, as well as local and migratory wild birds.

Migratory wild birds particularly act as reservoirs and can facilitate the spread of the virus across productive regions. There are no reports of the virus prevalence or circulation in Colombia so far, and no live vaccines have been approved to be used in poultry. This is a subdiagnosed disease, due to a combination of mild symptomatology in infected birds and the bias towards other diseases of the ARP. Based on this, the purpose of this project was to conduct a cross-sectional study aimed at determining the presence of aMPV and its molecular characteristics in commercial and wild birds across different regions of Colombia.

Samples were collected through convenience sampling from poultry farms, backyard poultry and from wild birds admitted to the Wildlife Rescue and Rehabilitation Unit of the Faculty of Veterinary Medicine and Animal Science at the Universidad Nacional de Colombia. 200 swabs from the respiratory and/or reproductive tract from poultry birds and 73 from wild birds were taken. Viral detection was carried out by amplification of the Nucleocapsid (N) and Glicoprotein (G) genes through PCR. Positive samples were sequenced and analyzed phylogenetic relationships and recombination events. So far, aMPV subtype B has been detected in 15 samples from poultry farms and one from a Rock Pidgeon (Columba livia).

These results demonstrate for the first-time molecular evidence of aMPV circulation in domestic and wild birds in Colombia, contributing to the understanding of viral dynamics, ecology, and preservation of wild bird populations as well as assuring food safety associated with poultry production. Also provide relevant epidemiological data to guide disease monitoring and control strategies in the country.

Keywords: Poultry diseases; Viruses; RNA; Pathogens; Molecular Biology; Molecular detection; PCR; Sequencing; Poultry; Wild birds

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