La relación entre el ambiente y el microbioma respiratorio de las aves

La diversidad bacteriana asociada al tracto aéreo y respiratorio ha sido escasamente estudiada en los sistemas de producción de pollos de engorde.

Un estudio realizado por investigadores chilenos examinó la relación entre el aire ambiental y el microbioma respiratorio de las aves, considerando un muestreo longitudinal. Se cuantificaron el total de bacterias y coliformes viables en el aire y se secuenció el gen 16S rRNA a partir de muestras traqueales y de aire obtenidas mediante un protocolo novedoso. Los resultados del aire mostraron una disminución de los coliformes con el tiempo.

Es de destacar que en la semana 3, se informa un aumento en los coliformes (de 143 a 474 UFCc/m³) asociados con el manejo de la cama. Además, los resultados del gen 16S rRNA indicaron una comunidad microbiana del aire distintiva, asociada principalmente con el Bacillota phylum, particularmente de la clase Bacilli (> 58%), en todas las condiciones. Los resultados traqueales indicaron predominio de Escherichia coli / Shigella al inicio del ciclo productivo, desplazándose hacia la mitad y final del ciclo a Gallibacterium. Sin embargo, en la semana 3 se destacó la dominancia de Escherichia coli / Shigella (> 99,5%) asociada a la aireación de la cama por volteo. Las muestras traqueales y de aire mostraron una estructura comunitaria estadísticamente diferente, pero compartieron características diferencialmente abundantes a lo largo del tiempo: Enterococcus, Gallibacterium y Romboutsia ilealis. Estos resultados indican el impacto de los protocolos de manejo de producción en el sistema respiratorio de las aves que deben considerarse un punto de quiebre en la salud de las granjas avícolas.

El ambiente en los sistemas intensivos de producción de pollo de engorde cobra relevancia porque se caracteriza por una alta densidad animal que facilita la acumulación de heces y humedad en la cama. Un sistema de cría de aves en el suelo crea condiciones favorables para el crecimiento bacteriano y concentraciones inadecuadas de amoníaco que pueden provocar problemas en el tracto respiratorio y aumentar la susceptibilidad a las infecciones. Por lo tanto, el manejo se implementa proporcionando ventilación adecuada al cobertizo y aireación de la cama mediante volteos.

Teniendo esto en cuenta, se busco estudiar la microbiota traqueal y las bacterias en el aire ambiente de galpones de pollos de engorde con ventilación túnel y de una instalación de animales experimentales al inicio, medio y final del ciclo de engorde (42 días). El objetivo fue analizar la posible influencia de las bacterias del aire ambiental sobre la microbiota respiratoria de las aves, considerando en el diseño experimental la aireación de la cama por volteo. Para ello se cuantificó la presencia de bacterias viables en el aire mediante el método de impacto en agar (UFC/m³). Además, la secuenciación del gen 16S rRNA completo se realizó en muestras traqueales y de aire (membrana de nitrocelulosa), lo que permitió la máxima resolución taxonómica.

El estudio proporciona el primer intento de arrojar luz sobre la influencia de las bacterias transmitidas por el aire en la microbiota respiratoria de un pollo de engorde.