Evaluación filogenética del gen Hemaglutinina de Avibacterium Paragallinarum y su relación con la serotipificación
Publicado:8 de octubre de 2014
Por:Abelardo Lenin Maturrano Hernández(Facultad de Medicina Veterinaria, Universidad Nacional Mayor de San Marcos Perú y Farvet), David Tarazona J., Ana Luz Chumbe Mendoza, Isabel García D., David Requena Anicama, Manolo Fernandez Diaz (Laboratorio de Biotecnología Molecular y Genómica – FARVET), Perú
Antecedentes
Avibacterium paragallinarum es el agente causal de la coriza infecciosa, enfermedad que afecta el tracto respiratorio superior de los pollos. La enfermedad es considerada de importancia económica en varios países del mundo. Diferentes factores se han asociado con la patogenicidad de A. paragallinarum incluyendo cápsulas, lipopolisacáridos y hemaglutinina A (HA). Esta última ha sido considerada como el factor de virulencia más importante, debido a su participación en la adhesión al tejido. La identificación del patógeno incluye la serotipificación a través de dos esquemas: el esquema de Page mediante pruebas de aglutinación en placa permite identificar tres serovariedades designadas como A, B y C; y el esquema de Kume que mediante pruebas de inhibición de la hemaglutinación, identifica hasta siete hemoaglutininas (HA-1 a H-A7) distribuidos en tres serogrupos (I, II, III). En este trabajo se realizó un análisis filogenético de todas las secuencias de hemaglutininas disponibles en la base de datos a la fecha, con la finalidad de establecer la diversidad del gen y su relación con las serovariedades y/o serogrupos.
Metodología
El análisis se realizó mediante alineamiento múltiple e inferencia bayesiana de 12 secuencias nucleotidicas del gen de hemaglutinina de la secuencia de Avibacterium paragallinarum aislada en Perú (Cepa 72) que fue obtenida por secuenciamiento con el 454 GS FLX Titanium. Se utilizó el modelo se sustitución nucleotídica HKY, tasa variación gamma; 1’100,000 repeticiones y como outgroup se utilizó la secuencia del gen de hemaglutinina de Pasteurella.
Resultados
Se observó que el árbol filogenético agrupó a las 12 secuencias en tres clados o grupos F1, F2 y F3. El clado F1 agrupó 5/12 cepas que comprenden los serovares A y C; el clado F2 agrupó 4/12 cepas correspondientes a los serovares A, B y C; y el clado F3 agrupó a 3/12 cepas correspondientes a los serovares A y C. Los resultados obtenidos nos muestran que existen 3 clados o grupos de genes HA en A. paragallinarum que no tienen relación con la serotipificación.
Conclusiones
Se abre la posibilidad de utilizar una secuencia de HA de cada clado para desarrollar una vacuna que permita proteger contra los tres tipos de HA. Y que existen otras proteínas que pueden estar implicadas en las diferencias observadas por serotipificación y que estas son posibles obtenerlas conociendo el genoma completo de Avibacterium paragallinarum.